Normu kritizují také podnikatelé, naopak odbory, jejichž pravomoci má prý zákoník posílit, normu podporovaly. I mezi nimi jsou ale nespokojenci - Federace strojvůdců kvůli zákoníku minulý čtvrtek stávkovala. Nelíbí se jí, že by kolektivní smlouvu měla uzavírat nejsilnější odborová organizace v podniku, kterou je v případě Českých drah Odborové sdružení železničářů.
Ministerstvo práce a sociálních věcí zákoník hájí s tím, že přináší větší smluvní volnost mezi zaměstnanci a zaměstnavateli. Mnohé záležitosti bude možné sjednat v kolektivních a dalších smlouvách.
Nový zákoník nicméně podle Tomáše Julínka (ODS) místo větší variability a volnosti pracovně-právních vztahů tuto oblast komplikuje natolik, že by se v případě jejího přijetí spíš vyplatila práce načerno než řádná práce. Josef Novotný (SNK) poznamenal, že navrhovaná "ochranářská opatření" zaměstnanců povedou i k odlivu investic z Česka.
Spory vyvolávaly hlavně pravomoci odborů. Podle nové normy by měly kontrolovat bezpečnost práce a při jejím ohrožení by mohly rozhodnout o zastavení výroby. Podle některých podnikatelů tak odboráři chtějí ovlivňovat hospodářskou politiku firem. Odpůrci kodexu již dříve upozorňovali na to, že by to mohlo být protiústavní.
