V novele zákona o DPH je bionafta zařazena mezi výrobky podléhající snížené pětiprocentní sazbě daně. Poznámka pod čarou však definuje bionaftu podle zákona o spotřebních daních, který platil do konce března 2000 a kde bionafta podléhala nulové sazbě spotřební daně.
Daňové zvýhodnění bionafty bylo novelou zákona o spotřebních daních zrušeno a ta je nyní zdaněna stejnou sazbou spotřební daně jako motorová nafta, tedy 8,15 Kč na litr. MF proto ve výkladu zákona vycházelo z právního názoru, že poznámka pod čarou v novele zákona o DPH není právně závazná.
Bionafta tudíž nebyla v právním předpise definována a protože podle nového znění zákona o spotřebních daních spadá do směsné nafty, celní orgány od 1. dubna u dovážené bionafty vyměřovaly základní sazbu daně 22 procent.
Rozhodnutí celníků však napadla Komora daňových poradců (KDP). Podle právního názoru KDP by měla snížené sazbě daně podléhat bionafta chápaná podle dříve platného zákona o spotřebních daních.
MF na základě názoru KDP změnilo předchozí výklad vazeb mezi oběma zákony. Proto také vypustí přesun bionafty ze snížené do základní sazby z návrhu novely zákona o DPH, který v současné době projednává legislativní rada vlády a který by měl vstoupit v platnost od příštího roku. Zanikne tak jeden ze zásadních rozporů, který má MF s ministerstvem zemědělství.
Zdroj: ČTK