Na základě zákona Česká národní banka hospodaří podle rozpočtu, který musí být členěn tak, aby z něj byly zřejmé výdaje na pořízení majetku a výdaje na provoz ČNB. Výdaje na pořízení majetku jsou pro rok 2006 plánovány na 270 milionů korun a výdaje na provoz na 1,815 miliardy korun. Nejvíce peněz poputuje na nákup techniky.
Česká národní banka hradí nezbytné náklady na svoji činnost z výnosů a není výdajovou kapitolou státního rozpočtu. Roční zprávy o výsledku hospodaření předkládá ČNB k projednání Poslanecké sněmovně a zároveň je již několik let pravidelně zveřejňuje na internetu.